Während des FÖJ sind die Freiwilligen auch selbstständig aktiv, indem sie ihre eigenen Projekte umsetzen. Von der Projektfindung und Recherche über die Projektbeschreibung, Materialbeschaffung und Durchführung bis hin zur Projektpräsentation und dem Abschlussbericht - alle Schritte werden von den Freiwilligen eigenverantwortlich übernommen. Der Fantasie der Freiwilligen in der Gestaltung und Themenwahl ihres Projekts sind dabei keine Grenzen gesetzt. Sie bestimmen selbst wie ihr Projekt aussehen soll und um welches Thema es sich dreht. Idealerweise kann das Projektergebnis auch nach dem FÖJ an der Einsatzstelle weitergenutzt werden. So entstand zum Beispiel im FÖJ 2014/2015  eine Holzgarderobe für die Gäste des Bergischen Energiekompetenzzentrums auf :metabolon.